Органические продукты

Группа ( тип) микроскопических, преимущественно одноклеточных организмов, обладающих клеточной стенкой, но не имеющих оформленного ядра ( роль его выполняет молекула ДНК), размножающихся делением. Бактерии широко распространены в природе (вызывают гниение, брожение и т. д.); некоторые бактерии используются в сельском хозяйстве (см. также азотобактер), для микробиологического синтеза и др.; болезнетворные ( патогенные) бактерии – возбудители многих болезней человека, животных и растений (см. также палочки и кокки).

автотрофные бактерии — autotrophic bacteria

Бактерии, которые могут синтезировать органические вещества из неорганичных в результате фотосинтеза или хемосинтеза (см. также автотрофы).

азотфиксирующие бактерии — nitrogen-fixing bacteria

Бактерии, обладающие способностью усваивать молекулярный азот воздуха и переводить его в доступные для растений формы. Играют важную роль в круговороте азота в природе (см. также азотфиксация).

анаэробные бактерии — anaerobic bacteria

Бактерии, использующие кислород в минимальных количествах для своей жизнедеятельности (см. также анаэробы).

ацетонбутиловые бактерии — acetone-butanol bacteria

Бактерии рода Clostridium (например, Clostridium acetobutylicum), у которых основными продуктами сбраживания углеводов являются ацетон и бутанол.

ацидофильные бактерии — acidophilic bacteria

аэробные бактерии — aerobic bacteria

Бактерии, которые требуют кислорода для основного ( элементарного) выживания, роста и процесса воспроизводства. Аэробные бактерии очень распространенны в природе и играют главную роль в самых разных биологических процессах (см. также аэробы).

водородные бактерии — hydrogenotrophic bacteria, hydrogen-oxidizing bacteria

Большая группа бактерий, способных к использованию ( окислению) молекулярного водорода. Различают анаэробные водородные бактерии, у которых окисление H₂ сопровождается восстановлением сульфата до сульфита или CO₂ до метана (например, Desulfovibrio vulgaris, Methanobacterium), и аэробные водородные бактерии, которые используют кислород как конечный акцептор электронов и способны к автотрофной фиксации CO₂ (например, Alcaligenes eutrophus, Pseudomonas facilis и другие).

газообразующие бактерии — gas-producing bacteria

Бактерии, обладающие способностью при росте на некоторых субстратах образовывать газ (H₂, CO₂ и другие). Это свойство используется как диагностический признак.

галофильные бактерии — halophilic bacteria

Бактерии, живущие в средах с высоким содержанием солей; встречаются на кристаллах соли в прибрежной полосе, на солёной рыбе, на засоленных шкурах животных, на рассольных сырах, в капустных и огуречных рассолах (см. также галобактерии).

гетеротрофные бактерии — heterotrophic bacteria

Бактерии, использующие в качестве источника энергии и углерода углеродсодержащие ( органические) соединения (см. также гетеротрофы).

грамвариабельные бактерии — gram-variable bacteria

грамотрицательные бактерии — gram-negative bacteria

Бактерии, которые при использовании окраски по Граму обесцвечиваются при промывке. После обесцвечивания они обычно окрашиваются дополнительным красителем ( фуксином) в розовый цвет. Многие грамотрицательные бактерии патогенны.

грамположительные бактерии — gram-positive bacteria

денитрифицирующие бактерии — denitrifying bacteria

Бактерии, способные восстанавливать нитрат через нитрит до газообразной закиси азота (N₂O) и азота (N₂) (например, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas stutzeri и другие). В отсутствие кислорода нитрат служит конечным акцептором водорода.

зелёные бактерии — green bacteria

Группа бактерий, для которых характерно наличие хлоросом – органелл, содержащих пигмент бактериохлорофилл.

извитые бактерии — spiral bacteria

клубеньковые бактерии — nodule bacteria, root nodule bacteria

Бактерии, вызывающие образование клубеньков у бобовых растений; относятся к родам Rhizobium, Bradyrhizobium, Sinorhizobium, Azorhizobium (см. также бактероиды).

колиподобные бактерии — coliform bacteria

колиформные бактерии — coliform bacteria

лизогенные бактерии — lysogenic bacteria

Бактерии, инфицированные умеренным фагом и включившие профаг в ДНК.

люминесцирующие бактерии — luminescent bacteria, luminous bacteria

бактерии лягушачьей икры — bacteria Leuconostoc mesenteroides

Гетероферментативные молочнокислые бактерии рода Leuconostoc. Образуют зооглеи – скопления клеток, заключенные в одну общую капсулу. При этом слизистые экзополимеры выделяются бактериальной клеткой в большом количестве, частично отделяются от неё и образуют рыхлый слизистый слой (см. также слизь).

маслянокислые бактерии — butyric-acid bacteria

Бактерии рода Clostridium (Clostridium butyricum, Clostridium pasteurianum, Clostridium pectinovorum), у которых основными продуктами сбраживания являются масляная и уксусная кислоты.

мезофильные бактерии — mesophilic bacteria

метанобразующие бактерии — methanogenic bacteria, methanogens

Бактерии, способные получать энергию за счёт восстановления CO₂ до метана; морфологически разнообразная группа, строгие анаэробы (см. также метаногены).

метаноокисляющие бактерии — methane oxidizing bacteria, methane oxidizers

метилотрофные бактерии — methylotrophic bacteria

молочнокислые бактерии — lactic-acid bacteria

бактерии, не образующие газа — non-gas-producing bacteria

бактерии, не способные адсорбировать фаг — nonreceptive bacteria

непатогенные бактерии — nonpathogenic bacteria

несерные пурпурные бактерии — purple nonsulphur bacteria

Группа бактерий с преимущественно фотогетеротрофным метаболизмом. Бактерии чувствительны к H₂S, их рост подавляется низкими концентрациями сульфида.

нитрифицирующие бактерии — nitrifying bacteria, nitrifiers

Бактерии, получающие энергию при окислении аммиака в нитрит или нитрита в нитрат. Наиболее известные виды – Nitrosomonas europaea и Nitrobacter winogradskyi, а также виды рода Nitrosolobus (см. также нитрификация).

нитчатые бактерии — filamentous bacteria

Бактерии, растущие в виде длинных нитей, состоящих из цепочки клеток ( раньше их называли охровыми бактериями). Нитчатые бактерии широко распространены в водах, богатых железом, канавах, дренажных трубах и болотах. Наиболее известна Sphaerotilus natans.

охровые бактерии — ochre bacteria

палочковидные бактерии — rodlike bacteria, rod-shaped bacteria, bacilli

Самая распространенная форма бактерий. Палочковидные бактерии различаются по форме, величине в длину и ширину, по форме концов клетки, а также по взаимному расположению. Палочки могут быть правильной и неправильной формы, в том числе ветвящиеся. Общее число палочковидных бактерий значительно больше, чем кокковидных (см. также бациллы).

патогенные бактерии — pathogenic bacteria

пигментообразующие бактерии — chromogenic bacteria

Группа бактерий (например, Mycobacterium tuberculosis, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens и другие) с яркой окраской, обусловленной пигментацией самой клетки. Среди пигментов могут встречаться представители различных классов веществ: каротиноиды, феназиновые красители, пирролы, азахиноны, антоцианы и другие.

почвенные бактерии — soil bacteria

пропионовокислые бактерии — propionic-acid bacteria

простековые бактерии — prostecobacteria

Бактерии, обладающие специальными выростами – простеками. Большинство простековых бактерий обнаружено среди олиготрофных микроорганизмов, обитающих в воде. У фотосинтезирующих зелёных бактерий рода Prosthecochloris в простеках располагаются хлоросомы, содержащие бактериохлорофилл.

психрофильные бактерии — psychrophilic bacteria

Холодолюбивые бактерии, растущие с максимальной скоростью при температурах ниже 2°C. Психрофильные бактерии составляют большую группу сапрофитических микроорганизмов – обитателей почвы, морей, пресных водоёмов, сточных вод. К ним относятся некоторые железобактерии, псевдомонады, светящиеся бактерии, бациллы и другие. Некоторые психрофильные бактерии могут вызывать порчу продуктов питания, хранящихся при низкой температуре (см. также психрофильные организмы).

пурпурные бактерии — purple bacteria

пурпурные серные бактерии — purple sulphur bacteria

Группа бактерий (например, Chromatium, Thiocapsa, Ectothiorhodospira и Thiospirillum jenense), входящая в состав пурпурных бактерий. Отличительной особенностью этой группы является внутриклеточное отложение серы, образующейся при окислении H₂S.

бактерии с простыми потребностями в питательных веществах — nonexacting bacteria

сапрофитные бактерии — saprophytic bacteria

светящиеся бактерии — luminescent bacteria

Хемоорганотрофные бактерии ( роды Photobacterium и Beneckea), в основном обитающие в морях; свечение этих бактерий наблюдается только в присутствии кислорода.

серные бактерии — sulphur bacteria

Бактерии, временно накапливающие или выделяющие серу. Для аэробных серных бактерий (роды Beggiatoa, Thiothrix, Achromatium, Thiovulum) сера служит источником энергии, для анаэробных фототрофных серных бактерий ( род Chromatium) – донором электронов. Включения серы у некоторых бактерий представляют собой продукты обеззараживания сероводорода, часто присутствующего в местах обитания этих организмов.

слизеобразующие бактерии — slime-forming bacteria

Бактерии, образующие капсулу ( более или менее толстые слои сильно обводнённого материала), которая отделяется в окружающую среду в виде слизи. Известный пример слизеобразующей бактерии – Leuconostoc mesenteroides, так называемая бактерия лягушачьей икры.

спорообразующие бактерии — spore-forming bacteria

стебельковые бактерии — stalked bacteria

сульфатредуцирующие бактерии — sulphate-reducing bacteria

Бактерии, встречающиеся главным образом в сероводородном иле, где органические вещества подвергаются анаэробному разложению. Эти бактерии приспособлены к использованию продуктов неполного разложения углеводов. Имеют большое экономическое значение, так как с их помощью можно, например, получать сероводород, а следовательно, и серу путём восстановления сульфатов морской воды за счёт органических отходов. К важнейшим и наиболее распространённым сульфатредуцирующим бактериям относятся Desulfovibrio desulfuricans, Desulfovibrio vulgaris, Desulfotomaculum nigrificans, Desulfotomaculum orientis и другие.

термофильные бактерии — thermophilic bacteria

Теплолюбивые бактерии, хорошо растущие при температурах выше 40°C, для большинства из них верхний предел температуры 70°C (Thermoactinomyces vulgaris, Bacillus stearothermophilus). Некоторые термофильные бактерии способны расти при температурах более 70°C ( отдельные виды Bacillus и Clostridium), более 80°C ( Sulfolobus acidocaldarius) или даже 105°C ( Pyrodictium occultum) (см. также чёрные курильщики).

уксуснокислые бактерии — acetic-acid bacteria, vinegar bacteria

Группа бактерий, способных образовывать кислоты путём неполного окисления сахаров или спиртов. Конечными продуктами такого окисления могут быть уксусная, гликолевая, нейлоновая и другие кислоты. Уксусные бактерии делятся на две группы: peroxydans ( типичный представитель Gluconobacter oxydans), т. е. организмы, накапливающие уксусную кислоту в качестве промежуточного продукта, и suboxydans (например, Acetobacter aceti и Acetobacter pasteurianum), у которых уксусная кислота не окисляется дальше. Благодаря своей способности почти в стехиометрических количествах превращать органические соединения в частично окисленные органические продукты, эти бактерии имеют большое промышленное значение, в частности, используются для производства уксуса из продуктов, содержащих спирт.

фототрофные бактерии — phototrophic bacteria

Бактерии, способные использовать свет как источник энергии, необходимой для роста. Это свойство присуще нескольким группам бактерий: 1) пурпурным, зёленым и галобактериям ( класс Anoxyphotobacteria), фотосинтез у которых протекает без выделения O₂, и 2) цианобактериям ( класс Oxyphotobacteria), выделяющим O₂ на свету (см. также фотосинтез).

хемолитоавтотрофные бактерии — chemolithoautotrophic bacteria

Большая группа хемолитотрофных бактерий, у которых CO₂ является единственным и главным источником клеточного углерода. Почти все бактерии этого типа ассимилируют углерод CO₂ через рибулозо-бисфосфатный цикл. Благодаря своей высокой специализации многие бактерии этой группы занимают монопольное положение в своей экологической нише.

хемолитогетеротрофные бактерии — chemolithoheterotrophic bacteria

хемолитотрофные бактерии — chemolithotrophic bacteria

Бактерии, способные использовать неорганические ионы или соединения (ионы аммония, нитрита, сульфида, тиосульфата, сульфита, двухвалентного железа, а также элементарную серу, молекулярный водород и CO) в качестве доноров водорода или электронов, т. е. получать за счёт их окисления энергию для синтетических процессов.

хромогенные бактерии — chromobacteria

Бактерии, образующие различные красящие вещества или пигменты, вследствие чего их скопления в природе и на искусственных средах являются окрашенными в различный цвет (см. также хромобактерии).

целлюлолитические бактерии — cellulose-fermenting bacteria, cellulolytic bacteria

Бактерии, разлагающие целлюлозу. Целлюлолитические бактерии секретируют, в основном, эндоглюканазы, большинство из которых проявляет низкую активность по отношению к кристаллической целлюлозе; являются важным звеном в круговороте углерода в природе и существенной частью экосистемы (см. также целлюлоза).

Метаболический процесс, при котором регенерируется АТФ, а продукты расщепления органического субстрата могут служить одновременно и донорами, и акцепторами водорода. Из трёх принципиально возможных способов регенерации АТФ (дыхание, брожение и фотосинтез) брожение – наиболее простой. Типы брожения могут быть разными в зависимости от того, какие продукты преобладают или являются особенно характерными.

ацетонбутиловое брожение — acetone-butanol fermentation

Сбраживание углеводов некоторыми специализированными видами анаэробных спорообразующих бактерий ( Clostridium acetobutylicum), приводящее к накоплению ацетона и бутанола.

аэробное брожение — aerobic fermentation, aerobic digestion

Брожение, идущее с участием кислорода и без добавления воды. Процесс сухого брожения может протекать при температуре от 15 до 45°C и естественной влажности; оптимальной температурой нужно считать 20-25°C. Аэробное брожение происходит в природе в широких масштабах и является единственным способом, при котором отходы с полей и лесов превращаются в перегной. Большое количество тепла, возникающего при аэробном брожении, убивает многие вредные организмы, поэтому аэробное брожение не даёт неприятного запаха (см. также ферментация).

бактериальное брожение — bacterial fermentation

гетероферментативное молочнокислое брожение — heterolactic fermentation

Брожение, в котором в отличие от гомоферментативного молочнокислого, не участвуют два главных фермента фруктозобисфосфатного пути – альдолазы и триозофосфатизомеразы. Продуктами такого брожения могут быть молочная кислота, этанол, двуокись углерода или уксусная кислота (образуют некоторые бактерии родов Leuconostoc, Lactobacillus и Bifidobacterium).

гомоацетатное брожение — homoacetate fermentation

Путь биосинтеза ацетата из двуокиси углерода и восстановительных эквивалентов ( электронов), освободившихся в первичных реакциях окисления гексозы ( осуществляется Clostridium thermoaceticum и другими клостридиями).

гомоферментативное молочнокислое брожение — homolactic fermentation

Брожение, осуществляемое некоторыми бактериями (представителями родов Streptococcus, Pediococcus, Lactobacillus), при котором образуется практически только одна молочная кислота (не менее 90%). Катаболизм глюкозы у этих бактерий происходит по фруктозобисфосфатному пути.

дрожжевое брожение — yeast fermentation

Процесс, лежащий в основе многих классических и старейших микробиологических производств (пивоварение, виноделие, выпечка хлеба, получение этанола и глицерина).

маслянокислое брожение — butyric-acid fermentation

Процесс сбраживания углеводов анаэробными спорообразующими бактериями – клостридиями (Clostridium butyricum, Clostridium tyrobutyricum, Clostridium pasteurianum), при котором образуются бутират, ацетат, CO₂. Из рубца жвачных животных были выделены некоторые роды анаэробных бактерий (например, Butyrivibrio fibrisolvens), близких к маслянокислым бактериям по продуктам брожения ( но не образующих спор), где они участвуют в разложении целлюлозы, крахмала и других углеводов.

молочнокислое брожение — lactic-acid fermentation

Процесс, в котором при сбраживании глюкозы образуются или только молочная кислота, или также и другие органические продукты и CO₂.

муравьинокислое брожение — formic acid fermentation

Процесс, в котором главным продуктом брожения является муравьиная кислота. На основании этого признака некоторые микроорганизмы объединены в одну физиологическую группу – семейство Enterobacteriaceae ( некоторые типичные представители этой группы обитают в кишечнике).

пропионовокислое брожение — propionic acid fermentation

спиртовое брожение — alcoholic fermentation

Сбраживание сахаров микроорганизмами, в котором главным продуктом является этиловый спирт ( этанол). Основные продуценты этанола – дрожжи ( Saccharomyces cerevisiae), осуществляющие сбраживание глюкозы по фруктозобисфосфатному пути до этанола и CO₂. У ряда анаэробных и факультативно-анаэробных бактерий этиловый спирт тоже является главным или побочным продуктом сбраживания гексоз или пентоз.

уксуснокислое брожение — acetic fermentation

Процесс образования уксусной кислоты ( ацетата) из CO₂ и восстановительных эквивалентов ( электронов), освободившихся в начальных окислительных реакциях (осуществляется, например Clostridium thermoaceticum). Уксусная кислота может быть также продуктом неполного окисления органических соединений при окислительном брожении или аэробной ферментации, осуществляемых уксуснокислыми бактериями ( Acetobacter).

Сложные органические вещества ( полипептиды), состоящие из аминокислот, соединённых пептидными ( амидными) связями; важнейшие компоненты живой клетки (см. также альбумины).

белок A — protein A

Продукт Staphylococcus aureus, способный связывать иммуноглобулин G; используется для измерения клеточных антигенов и антител. Образует комплексы с антителами, не нарушая их связывания с антигеном. В иммобилизованной форме используется в аффинной хроматографии для разделения подклассов иммуноглобулинов, а также в различных типах иммунопроб.

аллостерические белки — allosteric proteins

биосинтез белка — protein biosynthesis

белок вирусного происхождения — virus-related protein

высокое содержание белка — high protein concentration

гибридные белки — hybrid proteins

глобулярные белки — globular proteins

Белки, характеризующиеся более сложным способом свёртывания цепи по сравнению с фибриллярными. Эти белки сохраняют свою структуру преимущественно за счёт взаимодействия гидрофобных остатков. Примеры: миоглобин, лизоцим, карбоксипептидаза A.

денатурированные белки — denatured proteins

Белки, потерявшие свою естественную конфигурацию при воздействии дестабилизирующего агента, например тепла (см. также денатурация).

белки, дестабилизирующие спираль — helix-destabilizing proteins, HDP

железосерные белки — iron-sulfur protein

Входят в состав электрон-транспортных цепей ( участвуют в переносе протонов и электронов). Они содержат негеминовое железо, с одной стороны, связанное с атомами серы остатков цистеина, а с другой – с неорганической сульфидной серой. Помимо транспорта электронов в мембранах, эти белки участвуют в фиксации молекулярного азота, в восстановлении сульфита и нитрита, в фотосинтезе, в освобождении и активации молекулярного водорода и в окислении алканов. Железосерные белки имеют небольшую молекулярную массу ( порядка 10 кДа) и сильно отрицательный окислительно-восстановительный потенциал (см. также ферредоксины).

железосодержащие белки — iron proteins

интегральные белки — intrinsic proteins

мембранные белки — membrane proteins

нативный белок — native protein

Белок в своем естественном, in vivo состоянии, в противоположность денатурированному.

белок оболочки — coat protein

Структурный белок, из которого состоит оболочка вируса ( фага) и клеток микроорганизмов.

белки одноклеточных — single cell protein, SCP

периферические белки — extrinsic proteins

Мембранные белки, но в отличие от интегральных ( внутренних) белков они не пронизывают мембрану и связаны с ней менее прочно.

посттрансляционная модификация белка — post-translational protein modification

простые белки — simple proteins

расщепляющие белки — proteolytic proteins

Белки, осуществляющие гидролиз других белков. Продукты жизнедеятельности бактерий (например, Bacillus subtilis) и грибов. Используются в качестве добавки к моющим средствам, в кожевенной промышленности при дублении кожи, в научно-исследовательской практике.

регуляторные белки — regulatory proteins

Белки-посредники, обеспечивающие для эффекторов взаимодействие с ДНК (см. также репрессор и апорепрессор).

ренатурация белков — protein renaturation

Процесс, обратный денатурации, при котором белки возвращают свою нативную ( биологически активную) пространственную структуру (см. также ренатурация).

рибосомные белки — ribosomal proteins

Белки, входящие в состав рибосомы. Рибосомные белки характеризуются глобулярной компактной конформацией с развитой вторичной и третичной структурой; они занимают преимущественно периферическое положение в ядре, состоящем из рибосомной РНК (см. также рибосомный).

связывающие белки — binding proteins

секвенирование белка — protein sequencing

Аналитический метод, используемый для определения последовательности аминокислот, составляющих пептид или белок (см. также секвенирование).

синтез белков — protein synthesis

Химический метод синтеза пептидных связей (предложен в 1960 г. Мерифильдом, США). Этот метод получил название твёрдофазного синтеза пептидов. Метод Мерифильда прост в техническом оформлении, что позволяет полностью автоматизировать процесс.

сложные белки — conjugated proteins, proteids

структурные белки — structural proteins

сырой белок — crude protein

хромосомные структурные белки — chromosomal scaffolding proteins

Гистоны - структурные белки эукариотических хромосом; относительно небольшие белки с очень большой долей положительно заряженных аминокислот ( лизина и аргинина); положительный заряд помогает гистонам прочно связываться с ДНК ( которая заряжена сильно отрицательно) независимо от её нуклеотидной последовательности (см. также хромосомный).